De la microscopie 3D terapixel à la simulation numérique exascale : une solution collaborative et sécurisée pour l’innovation thérapeutique.
Le projet 3DNeuroSecure vise à utiliser de manière innovante le potentiel du calcul haute performance. L’objectif est de confronter les données massives issues d’images 3D de cerveau entier à l’échelle microscopique dans des modèles expérimentaux (images non compressées pouvant dépasser 100 To par cerveau de souris). Ainsi que les données d’imagerie cellulaire à haut débit avec les données de simulations numériques à l’échelle atomique (modélisations jusqu’à un milliard d’atomes dans des conditions mimant le vivant, notamment au niveau de l’hydratation et des membranes cellulaires).
De la microscopie 3D terapixel à la simulation numérique exascale : une solution collaborative sécurisée pour l’innovation thérapeutique de rupture pour les domaines de la recherche médicale et pharmaceutique et au bénéfice de la neuroclinique.
Un microscope virtuel qui propose une interface interactive de navigation/annotation dans les données 3D capturées, puis stockées de façon appropriée à leur navigation temps réel sans stockage complet en mémoire.
Le projet intègre un ensemble de composants technologiques (HPC, 3D haute volumétrie, collaboratif temps-réel sécurisé) que Neoxia maîtrise individuellement mais auxquels, seule, elle ne peut avoir accès de part les moyens humains et financiers qu’il est nécessaire de déployer. Le consortium apporte ainsi à Neoxia la possibilité d’exploiter son savoir-faire sur ces technologies pour concevoir et exécuter une stratégie produit innovante et ambitieuse.
Gilles Mergoil - Coordinateur du projetLe projet 3D NeuroSecure vise à sélectionner et développer des molécules contre de nouvelles cibles thérapeutiques identifiées dans la maladie d’Alzheimer qui est prise comme preuve de concept.
Neoxia se positionne dans ce projet comme le pilote et le coordinnateur de l’ensemble des équipes du projet. Il sera aussi celui qui va concevoir la stratégie marketing produit en vue de la commercialisation de ses différentes déclinaisons et leurs déploiements. Neoxia agrège les savoir-faire indispensables à la conception d’innovations technologiques (R&D) et d’usage (design et ergonomie) jusqu’à leur mise en œuvre industrielle sur le marché (management de projets innovants, prototypage, industrialisation).
http://www.neoxia.com/Ses cartes graphiques ou GPUs sont utilisées pour les traitements les plus contraignants et nécessitant chaque jour une plus grande puissance de calcul. Les avantages sont nombreux et permettent de dépasser de nombreuses limites : diminuer le nombre d’unités matérielles, les coûts des investissements matériels et la consommation énergétique. L’entreprise est à l’origine de la rupture technologique introduite par des architectures massivement parallèles ou many-cœurs pour des applications comme Shazam ou Salesforce.
http://www.nvidia.fr/ARCHOS a sans cesse révolutionné ce marché et propose aujourd’hui des tablettes, des smartphones ainsi que des objets connectés au niveau mondial. En 2016, elle crée Connected Avenue, une division dédiée à la commercialisation exclusive de produits à forte valeur d’innovation, dans des secteurs connexes à ceux des tablettes et des smartphones : mobilité urbaine, drones de loisir et jouets intelligents.
http://archos.com/ http://logic-instrument.com/Les équipes du CEA DAM, Dép. de Physique Théorique et Appliquée travaillent dans le domaine R&D sur la simulation et le calcul scientifique (calcul haute performance), la surveillance de l'environnement et le respect des traités internationaux, ainsi que sur l'électronique et la physique nucléaire.
http://www.cea.fr/Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA et sa direction des sciences du vivant tachent de répondre à des enjeux sociétaux majeurs. Elle a pour mission de développer et d’évaluer des stratégies de recherche en réponse aux problèmes de santé publique, de fournir une plateforme d’imagerie préclinique dédiée à l’étude des maladies neurodégénératives ainsi que de concevoir des ligands protéiques artificiels par simulation des protéines et de leurs interactions.
http://www.cea.fr/TRIBVN est une PME française spécialisée dans l'acquisition et l'interprétation des images de microscopie. Elle a développé et vend CaloPix, une plateforme d'intégration dans les laboratoires de clinique et de recherche clinique des images de macroscopie et de microscopie. Elle s'intègre dans le flux de production de l'hôpital entre le système d'information de laboratoire et le système d'archivage pour plus de 400 clients.
http://www.tribvn.com/L’ESIEA étudie le domaine de la sécurité informatique - principalement en virologie et en cryptologie - de la lutte informatique défensive avec applications opérationnelles à la lutte informatique offensive. Privilégiant à la fois l’approche théorique, son objectif principal est non seulement de comprendre les attaques informatiques actuelles mais surtout de prévoir et d’inventer les attaques futures.
https://www.esiea.fr/Le Centre de Recherches en STIC - CRESTIC de l'Université de Reims Champagne-Ardenne, mobilise ses compétences en simulation sur architecture HPC accélérée et en imagerie numérique en 3D relief auto-stéréoscopique. La Maison de la Simulation avec le Centre de Calcul ROMEO fournit pour le projet le plus puissant supercalculateur « vert » de France.
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